細(xì)菌送樣有哪些要求？

　　隨著高通量測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)的快速發(fā)展，細(xì)菌全基因組de novo測(cè)序已然成為一種探究細(xì)菌生物學(xué)問(wèn)題的高性價(jià)比方法。通過(guò)全基因組測(cè)序，可以獲知待測(cè)菌株的基因及相關(guān)調(diào)控信息，為研究該菌株特有的生物學(xué)特征（致病機(jī)制，共生機(jī)制，獨(dú)有的代謝機(jī)制）提供分子生物學(xué)基礎(chǔ)；通過(guò)比較基因組分析，為研究菌株種內(nèi)及種間的功能差異、進(jìn)化關(guān)系提供理論指導(dǎo)。

樣品類型：菌體

送樣要求：菌體不宜培養(yǎng)時(shí)間過(guò)長(zhǎng)，以對(duì)數(shù)生長(zhǎng)中期細(xì)胞**；

樣品量：掃描圖≥3O D·mL的菌液對(duì)應(yīng)的菌體沉淀，完成圖≥50O D·mL的菌液對(duì)應(yīng)的菌體沉淀；D·mL=OD600的值*菌液體積

將裝有菌體沉淀的離心管在干冰/冰袋條件下寄送，或是暫時(shí)存放于-80℃后再干冰/冰袋寄送。另送1-2份樣品備份；

樣品類型：DNA

送樣要求樣品量：掃描圖DNA總量≥1μg，濃度≥20ng/μL，完成圖DNA總量≥1μg，濃度≥20ng/μL；

DNA質(zhì)量：OD260/280=1.8-2.0，OD260/230=1.8-2.2；DNA的主峰帶明顯且在2kb以上，無(wú)明顯RNA污染；

為了避免DNA樣品的降解，寄送過(guò)程中務(wù)必保證足夠的干冰/冰袋，避免樣品反復(fù)凍融，送樣時(shí)注明溶劑組分；

注：老師在拿到DNA膠圖后，如不確定樣品是否合格，可在送樣之前先將膠圖發(fā)送到mdna@majorbio.com，由技術(shù)人員評(píng)估確認(rèn)后再進(jìn)行樣品寄送；病原微生物只接受DNA樣本。